Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC51Q96ER9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC51Q96ER9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC51Q96ER9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms