Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF62

ATP8B4, Probable phospholipid-transporting ATPase IM, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B4Q8TF62 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B4Q8TF62 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B4Q8TF62 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8B4Q8TF62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8B4Q8TF62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B4Q8TF62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B4Q8TF62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms