Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALB2Q86YC2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALB2Q86YC2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms