Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRTM3Q86VH5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRTM3Q86VH5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms