Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RD3Q7Z3Z2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RD3Q7Z3Z2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms