Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 PEF1-208ENST00000496805 742 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-202ENST00000461006 732 ntTSL 512.44□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-211ENST00000635033 1358 ntTSL 511.72□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 511.23□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 211.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-210ENST00000552275 754 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 PEF1-203ENST00000471219 401 ntTSL 39.35□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-207ENST00000550716 486 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ASXL2-204ENST00000497092 549 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 GALNT7-203ENST00000503213 648 ntTSL 37.15□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.49□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ELMOD2-202ENST00000502290 558 ntTSL 36.32□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 27.7
SND1Q7KZF4 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.837e-18■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 AFP-204ENST00000508838 728 ntTSL 26.31□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SLC6A14-201ENST00000463626 344 ntTSL 34.74□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SERPINA5-209ENST00000555681 618 ntTSL 213.85□□□□□ -0.196e-14■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SERPINA5-213ENST00000557598 607 ntTSL 28.99□□□□□ -0.976e-14■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.53e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.53e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.293e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 ADPGK-214ENST00000569693 1820 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.533e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 ADPGK-204ENST00000562621 4576 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.863e-20■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SLC2A3-210ENST00000544291 577 ntTSL 55.77□□□□□ -1.495e-9■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 CEPT1-203ENST00000467362 5300 ntTSL 24.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 TSPAN9-203ENST00000431374 558 ntTSL 415.81■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 27.6
SND1Q7KZF4 AGRN-209ENST00000492947 690 ntTSL 217.51■□□□□ 0.394e-14■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.952e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HYAL2-210ENST00000481597 1513 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GLB1-208ENST00000446732 631 ntTSL 37.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PLOD3-203ENST00000421736 809 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 413.84□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-70■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.785e-70■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-217ENST00000553145 552 ntTSL 419.38■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-13■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-13■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 HDAC4-207ENST00000461113 1019 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GDAP1-204ENST00000521096 806 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 SLC16A1-205ENST00000478835 452 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.471e-13■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 311.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 CPZ-206ENST00000513486 663 ntTSL 211.22□□□□□ -0.613e-9■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 GDAP1-203ENST00000520797 735 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.53□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.66□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 27.5
SND1Q7KZF4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 ICAM1-204ENST00000588645 581 ntTSL 216.21■□□□□ 0.198e-21■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.22e-13■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 28.5□□□□□ -1.056e-15■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-18■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.539e-12■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 09e-12■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.379e-12■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.79e-12■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 PCDHB2-204ENST00000624994 162 ntTSL 310.62□□□□□ -0.719e-14■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.297e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-206ENST00000473576 810 ntTSL 226.55■■□□□ 1.847e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.847e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.447e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 EBPL-207ENST00000495963 1026 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 AMN-207ENST00000559789 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.29■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 27.4
SND1Q7KZF4 CPQ-208ENST00000529551 896 ntTSL 210.55□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 27.3
SND1Q7KZF4 CPQ-209ENST00000532528 810 ntTSL 37.49□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 27.3
SND1Q7KZF4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 13,567 protein–RNA pairs in 58.9 ms