Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFNL1Q499Z3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFNL1Q499Z3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLFNL1Q499Z3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFNL1Q499Z3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2516.2 ms