Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRNQ16849 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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PTPRNQ16849 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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PTPRNQ16849 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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PTPRNQ16849 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRNQ16849 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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PTPRNQ16849 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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PTPRNQ16849 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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