Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRNQ16849 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRNQ16849 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRNQ16849 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRNQ16849 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRNQ16849 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRNQ16849 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRNQ16849 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRNQ16849 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRNQ16849 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRNQ16849 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRNQ16849 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRNQ16849 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRNQ16849 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRNQ16849 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRNQ16849 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRNQ16849 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRNQ16849 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRNQ16849 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRNQ16849 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRNQ16849 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRNQ16849 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRNQ16849 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRNQ16849 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRNQ16849 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRNQ16849 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRNQ16849 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRNQ16849 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRNQ16849 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRNQ16849 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRNQ16849 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRNQ16849 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRNQ16849 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRNQ16849 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRNQ16849 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRNQ16849 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRNQ16849 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRNQ16849 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRNQ16849 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRNQ16849 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRNQ16849 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRNQ16849 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRNQ16849 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRNQ16849 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRNQ16849 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRNQ16849 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRNQ16849 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRNQ16849 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRNQ16849 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRNQ16849 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRNQ16849 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRNQ16849 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRNQ16849 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRNQ16849 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRNQ16849 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRNQ16849 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRNQ16849 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRNQ16849 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRNQ16849 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRNQ16849 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRNQ16849 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRNQ16849 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRNQ16849 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRNQ16849 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRNQ16849 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRNQ16849 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRNQ16849 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRNQ16849 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRNQ16849 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRNQ16849 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRNQ16849 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRNQ16849 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRNQ16849 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRNQ16849 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRNQ16849 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRNQ16849 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRNQ16849 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRNQ16849 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRNQ16849 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRNQ16849 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRNQ16849 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRNQ16849 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRNQ16849 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRNQ16849 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRNQ16849 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRNQ16849 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRNQ16849 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRNQ16849 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRNQ16849 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRNQ16849 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRNQ16849 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRNQ16849 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRNQ16849 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRNQ16849 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRNQ16849 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRNQ16849 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRNQ16849 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRNQ16849 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRNQ16849 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRNQ16849 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
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