Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LY6EQ16553 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LY6EQ16553 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LY6EQ16553 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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