Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MKNK2-204ENST00000586620 1135 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ARPC1B-220ENST00000491294 1051 ntTSL 518.67■□□□□ 0.581e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)18.51■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 518.22■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PAFAH1B1-211ENST00000576586 557 ntTSL 417.68■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ARPC1B-217ENST00000481997 945 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-8■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 RUVBL2-212ENST00000627972 1065 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 423.37■■□□□ 1.334e-29■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 19.4
PUM1Q14671 PPIB-202ENST00000558492 381 ntTSL 39.33□□□□□ -0.923e-8■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-9■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-9■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-9■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-7■■■■□ 19.3
PUM1Q14671 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 IK-209ENST00000515592 1964 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-9■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-8■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-8■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 DDX23-212ENST00000552069 592 ntTSL 36.98□□□□□ -1.292e-8■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 ACSM3-202ENST00000440284 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.866e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 ACSM3-207ENST00000562251 1931 ntTSL 26.87□□□□□ -1.316e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 ATP5A1-204ENST00000586523 4547 nt6.15□□□□□ -1.425e-12■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 ACSM3-206ENST00000561795 580 ntTSL 45.33□□□□□ -1.566e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.796e-6■■■□□ 19.2
PUM1Q14671 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-8■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-8■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.44e-7■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.317e-8■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 418.76■□□□□ 0.593e-11■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 512.86□□□□□ -0.353e-11■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 510.88□□□□□ -0.673e-11■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 58.9□□□□□ -0.983e-11■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 BRD7-206ENST00000567826 740 ntTSL 528.49■■■□□ 2.158e-8■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 BRD7-203ENST00000401491 1338 ntTSL 528.43■■■□□ 2.148e-8■■■□□ 19.1
PUM1Q14671 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-8■■■□□ 19
PUM1Q14671 DCTN2-210ENST00000548736 565 ntTSL 48.36□□□□□ -1.073e-6■■■□□ 19
PUM1Q14671 DCTN2-223ENST00000551872 571 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 19
PUM1Q14671 DNAJC2-209ENST00000475090 480 ntTSL 54.38□□□□□ -1.712e-12■■■□□ 19
PUM1Q14671 RPL31-211ENST00000456292 357 ntTSL 25.43□□□□□ -1.542e-12■■■□□ 19
PUM1Q14671 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-6■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.065e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.026e-6■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-207ENST00000556831 729 ntTSL 214.77□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 213.45□□□□□ -0.269e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■■■□□ 19
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PUM1Q14671 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-7■■■□□ 19
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PUM1Q14671 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 27.99□□□□□ -1.135e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 34.17□□□□□ -1.745e-7■■■□□ 19
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PUM1Q14671 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 57.48□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.771e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-210ENST00000627604 565 ntTSL 422.16■■□□□ 1.141e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-204ENST00000465887 2118 ntTSL 214.59□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-206ENST00000489647 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 POLR1D-222ENST00000637389 129 ntTSL 52.18□□□□□ -2.061e-7■■■□□ 19
PUM1Q14671 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-9■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 EIF3I-204ENST00000474371 643 ntTSL 37.82□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.537e-7■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.387e-7■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 CWC15-206ENST00000621358 1113 ntTSL 58.68□□□□□ -1.023e-6■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.173e-6■■■□□ 18.9
PUM1Q14671 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.463e-6■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 229.34■■■□□ 2.295e-12■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.335e-12■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.85e-12■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 SRSF11-210ENST00000469170 668 ntTSL 217.83■□□□□ 0.445e-12■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 GRK6-210ENST00000515666 2141 ntTSL 514.52□□□□□ -0.095e-12■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 526.57■■□□□ 1.842e-7■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-7■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 IGBP1-201ENST00000342206 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.636e-7■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 IGBP1-202ENST00000356413 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.926e-7■■■□□ 18.8
PUM1Q14671 RBM25-209ENST00000531500 1039 ntTSL 311.13□□□□□ -0.631e-6■■■□□ 18.8
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