Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A6Q14031 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A6Q14031 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COL4A6Q14031 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL4A6Q14031 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms