Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
COL4A6Q14031 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
COL4A6Q14031 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
COL4A6Q14031 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
COL4A6Q14031 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
COL4A6Q14031 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
COL4A6Q14031 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
COL4A6Q14031 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
COL4A6Q14031 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
COL4A6Q14031 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
COL4A6Q14031 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL4A6Q14031 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL4A6Q14031 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
COL4A6Q14031 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL4A6Q14031 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL4A6Q14031 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL4A6Q14031 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL4A6Q14031 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
COL4A6Q14031 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL4A6Q14031 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL4A6Q14031 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL4A6Q14031 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL4A6Q14031 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL4A6Q14031 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL4A6Q14031 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL4A6Q14031 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL4A6Q14031 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL4A6Q14031 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL4A6Q14031 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL4A6Q14031 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COL4A6Q14031 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL4A6Q14031 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL4A6Q14031 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
COL4A6Q14031 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
COL4A6Q14031 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL4A6Q14031 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL4A6Q14031 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
COL4A6Q14031 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
COL4A6Q14031 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL4A6Q14031 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL4A6Q14031 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL4A6Q14031 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL4A6Q14031 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL4A6Q14031 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
COL4A6Q14031 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL4A6Q14031 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL4A6Q14031 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL4A6Q14031 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COL4A6Q14031 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
COL4A6Q14031 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL4A6Q14031 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL4A6Q14031 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL4A6Q14031 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL4A6Q14031 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL4A6Q14031 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COL4A6Q14031 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL4A6Q14031 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL4A6Q14031 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL4A6Q14031 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL4A6Q14031 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL4A6Q14031 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL4A6Q14031 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL4A6Q14031 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL4A6Q14031 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL4A6Q14031 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL4A6Q14031 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
COL4A6Q14031 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL4A6Q14031 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL4A6Q14031 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL4A6Q14031 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL4A6Q14031 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL4A6Q14031 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL4A6Q14031 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL4A6Q14031 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A6Q14031 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL4A6Q14031 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL4A6Q14031 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A6Q14031 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
COL4A6Q14031 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL4A6Q14031 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL4A6Q14031 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL4A6Q14031 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
COL4A6Q14031 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COL4A6Q14031 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COL4A6Q14031 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COL4A6Q14031 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
COL4A6Q14031 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
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