Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXE3Q13461 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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