Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFSWAPQ12872 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFSWAPQ12872 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFSWAPQ12872 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms