Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM27E3Q08E93 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM27E3Q08E93 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms