Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1CAP62136 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1CAP62136 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1CAP62136 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1CAP62136 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms