Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB4P54760 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB4P54760 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB4P54760 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms