Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK8P49336 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK8P49336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK8P49336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK8P49336 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK8P49336 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK8P49336 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK8P49336 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK8P49336 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK8P49336 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK8P49336 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK8P49336 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK8P49336 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK8P49336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK8P49336 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK8P49336 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK8P49336 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK8P49336 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK8P49336 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK8P49336 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK8P49336 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK8P49336 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK8P49336 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK8P49336 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDK8P49336 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK8P49336 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK8P49336 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK8P49336 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK8P49336 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK8P49336 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK8P49336 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK8P49336 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK8P49336 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK8P49336 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK8P49336 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK8P49336 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK8P49336 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK8P49336 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK8P49336 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK8P49336 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK8P49336 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK8P49336 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK8P49336 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms