Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP4AP20648 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP4AP20648 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP4AP20648 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms