Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPBP14678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPBP14678 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPBP14678 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPBP14678 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPBP14678 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPBP14678 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms