Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF1P10914 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF1P10914 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF1P10914 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF1P10914 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF1P10914 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF1P10914 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF1P10914 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF1P10914 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF1P10914 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF1P10914 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF1P10914 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF1P10914 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRF1P10914 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF1P10914 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF1P10914 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF1P10914 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF1P10914 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF1P10914 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF1P10914 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF1P10914 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF1P10914 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF1P10914 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF1P10914 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF1P10914 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF1P10914 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF1P10914 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF1P10914 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF1P10914 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF1P10914 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms