Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCB11O95342 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB11O95342 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCB11O95342 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCB11O95342 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCB11O95342 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB11O95342 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB11O95342 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCB11O95342 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCB11O95342 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms