Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms