Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms