Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THRBP10828 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THRBP10828 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THRBP10828 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THRBP10828 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THRBP10828 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THRBP10828 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THRBP10828 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THRBP10828 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THRBP10828 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms