Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRRN3Q9H3W5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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