Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3P08700 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3P08700 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3P08700 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3P08700 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms