Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IL3P08700 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IL3P08700 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
IL3P08700 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
IL3P08700 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
IL3P08700 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IL3P08700 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
IL3P08700 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IL3P08700 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
IL3P08700 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IL3P08700 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
IL3P08700 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IL3P08700 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IL3P08700 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IL3P08700 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IL3P08700 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IL3P08700 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IL3P08700 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IL3P08700 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IL3P08700 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IL3P08700 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IL3P08700 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IL3P08700 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IL3P08700 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IL3P08700 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IL3P08700 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IL3P08700 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IL3P08700 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IL3P08700 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IL3P08700 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IL3P08700 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IL3P08700 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IL3P08700 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IL3P08700 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IL3P08700 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IL3P08700 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IL3P08700 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IL3P08700 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IL3P08700 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IL3P08700 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IL3P08700 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IL3P08700 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IL3P08700 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IL3P08700 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL3P08700 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IL3P08700 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IL3P08700 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL3P08700 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL3P08700 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL3P08700 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IL3P08700 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IL3P08700 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL3P08700 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL3P08700 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IL3P08700 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IL3P08700 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IL3P08700 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL3P08700 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL3P08700 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL3P08700 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL3P08700 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL3P08700 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IL3P08700 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL3P08700 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL3P08700 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL3P08700 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL3P08700 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL3P08700 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IL3P08700 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IL3P08700 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IL3P08700 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IL3P08700 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IL3P08700 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IL3P08700 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IL3P08700 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IL3P08700 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IL3P08700 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IL3P08700 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IL3P08700 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IL3P08700 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL3P08700 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL3P08700 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IL3P08700 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IL3P08700 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IL3P08700 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
IL3P08700 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IL3P08700 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IL3P08700 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IL3P08700 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IL3P08700 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IL3P08700 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IL3P08700 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IL3P08700 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IL3P08700 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL3P08700 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IL3P08700 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL3P08700 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IL3P08700 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IL3P08700 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL3P08700 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms