RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392996.2

ZBTB16-202, Transcript of zinc finger and BTB domain containing 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBTB16, Length 2,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBTB16-202ENST00000392996 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.72■■■□□ 2.19
ZBTB16-202ENST00000392996 SMARCA2P51531 1590 aa28.7■■■□□ 2.19
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ZBTB16-202ENST00000392996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.42■■■□□ 2.14
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ZBTB16-202ENST00000392996 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
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ZBTB16-202ENST00000392996 SOGA1O94964 1423 aa27.78■■■□□ 2.04
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ZBTB16-202ENST00000392996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.19■■□□□ 1.94
ZBTB16-202ENST00000392996 CUX2O14529 1486 aa27.18■■□□□ 1.94
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ZBTB16-202ENST00000392996 KIF27Q86VH2 1401 aa27.16■■□□□ 1.94
ZBTB16-202ENST00000392996 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.16■■□□□ 1.94
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ZBTB16-202ENST00000392996 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.86■■□□□ 1.89
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ZBTB16-202ENST00000392996 WDR62O43379 1518 aa26.76■■□□□ 1.87
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ZBTB16-202ENST00000392996 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
ZBTB16-202ENST00000392996 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ZBTB16-202ENST00000392996 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ZBTB16-202ENST00000392996 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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ZBTB16-202ENST00000392996 ARAP1Q96P48 1450 aa26.55■■□□□ 1.84
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