Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CA9Q16790 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CA9Q16790 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CA9Q16790 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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CA9Q16790 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CA9Q16790 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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