Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD23AP54725 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms