RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.96■■■■■ 4.15
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PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.78■■■■□ 3.48
PTPRC-206ENST00000413409 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.76■■■■□ 3.32
PTPRC-206ENST00000413409 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.26
PTPRC-206ENST00000413409 NACADO15069 1562 aa35.3■■■■□ 3.24
PTPRC-206ENST00000413409 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.03■■■■□ 3.2
PTPRC-206ENST00000413409 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.99■■■■□ 3.19
PTPRC-206ENST00000413409 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRC-206ENST00000413409 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRC-206ENST00000413409 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.42■■■■□ 3.1
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.36■■■■□ 3.09
PTPRC-206ENST00000413409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPRC-206ENST00000413409 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPRC-206ENST00000413409 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PTPRC-206ENST00000413409 SCRIBQ14160 1630 aa33.79■■■■□ 3
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PTPRC-206ENST00000413409 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.72■■■□□ 2.99
PTPRC-206ENST00000413409 CUX2O14529 1486 aa33.17■■■□□ 2.9
PTPRC-206ENST00000413409 ERCC6Q03468 1493 aa32.91■■■□□ 2.86
PTPRC-206ENST00000413409 NCAPD3P42695 1498 aa32.67■■■□□ 2.82
PTPRC-206ENST00000413409 NESP48681 1621 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRC-206ENST00000413409 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.45■■■□□ 2.78
PTPRC-206ENST00000413409 TRIM41Q8WV44 630 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRC-206ENST00000413409 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PTPRC-206ENST00000413409 HMGXB3Q12766 1538 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRC-206ENST00000413409 SMARCA2P51531 1590 aa32.22■■■□□ 2.75
PTPRC-206ENST00000413409 SMARCA4P51532 1647 aa32.13■■■□□ 2.73
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PTPRC-206ENST00000413409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRC-206ENST00000413409 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.88■■■□□ 2.69
PTPRC-206ENST00000413409 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.81■■■□□ 2.68
PTPRC-206ENST00000413409 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
PTPRC-206ENST00000413409 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.67■■■□□ 2.66
PTPRC-206ENST00000413409 WDR62O43379 1518 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRC-206ENST00000413409 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRC-206ENST00000413409 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.6■■■□□ 2.65
PTPRC-206ENST00000413409 OSCARQ8IYS5 282 aa31.56■■■□□ 2.64
PTPRC-206ENST00000413409 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRC-206ENST00000413409 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRC-206ENST00000413409 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRC-206ENST00000413409 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRC-206ENST00000413409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRC-206ENST00000413409 WIZO95785 1651 aa31.13■■■□□ 2.57
PTPRC-206ENST00000413409 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
PTPRC-206ENST00000413409 CFTRP13569 1480 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF11O15085 1522 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRC-206ENST00000413409 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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PTPRC-206ENST00000413409 IFT140Q96RY7 1462 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRC-206ENST00000413409 ARAP1Q96P48 1450 aa30.71■■■□□ 2.51
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PTPRC-206ENST00000413409 TOPBP1Q92547 1522 aa30.57■■■□□ 2.48
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PTPRC-206ENST00000413409 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
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PTPRC-206ENST00000413409 FBLN2P98095 1184 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRC-206ENST00000413409 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.37■■■□□ 2.45
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC8Q09428 1581 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRC-206ENST00000413409 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRC-206ENST00000413409 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PTPRC-206ENST00000413409 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.2■■■□□ 2.43
PTPRC-206ENST00000413409 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PTPRC-206ENST00000413409 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRC-206ENST00000413409 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRC-206ENST00000413409 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PTPRC-206ENST00000413409 SOGA1O94964 1423 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRC-206ENST00000413409 SYNJ1O43426 1573 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRC-206ENST00000413409 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRC-206ENST00000413409 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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PTPRC-206ENST00000413409 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRC-206ENST00000413409 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
PTPRC-206ENST00000413409 GRIN2BQ13224 1484 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRC-206ENST00000413409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.73■■■□□ 2.35
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PTPRC-206ENST00000413409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRC-206ENST00000413409 GRIN2AQ12879 1464 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRC-206ENST00000413409 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRC-206ENST00000413409 NUP160Q12769 1436 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRC-206ENST00000413409 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRC-206ENST00000413409 SHROOM2Q13796 1616 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRC-206ENST00000413409 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS12P58397 1594 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPRC-206ENST00000413409 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PTPRC-206ENST00000413409 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPRC-206ENST00000413409 JPH4Q96JJ6 628 aa29.18■■■□□ 2.26
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