Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.355e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.485e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.665e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 LTBP3-204ENST00000525443 3162 ntTSL 213.79□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.486e-9■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 222.13■■□□□ 1.136e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ARFGEF1-206ENST00000519436 571 ntTSL 319.81■□□□□ 0.761e-22■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 SERTAD2-202ENST00000476805 1068 ntTSL 318.91■□□□□ 0.623e-9■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.576e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.326e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.086e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 AC140504.1-203ENST00000567442 476 ntTSL 215.47■□□□□ 0.076e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.056e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-22■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.586e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 IKZF4-210ENST00000551103 3683 ntTSL 29.76□□□□□ -0.856e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RCOR3-212ENST00000529572 1022 ntTSL 57.58□□□□□ -1.26e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.616e-8■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-204ENST00000609143 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-205ENST00000609401 2886 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LINC01278-202ENST00000608623 5053 nt3.52□□□□□ -1.856e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-20■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.921e-323■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-24■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PROSER3-216ENST00000620918 3606 ntTSL 512.39□□□□□ -0.434e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PROSER3-210ENST00000542591 646 ntTSL 39.73□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 NFIX-212ENST00000590027 579 ntTSL 214.06□□□□□ -0.167e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 511.34□□□□□ -0.597e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PDGFC-202ENST00000422544 849 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.997e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-10■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-10■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-10■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.812e-10■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-10■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 HNRNPF-205ENST00000477108 636 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.064e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 58.39□□□□□ -1.078e-7■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LDLRAD4-212ENST00000587905 743 ntTSL 519.32■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 TMEM104-206ENST00000584171 574 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-18■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.647e-23■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ITIH3-205ENST00000465243 824 ntTSL 59.34□□□□□ -0.917e-23■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.067e-23■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.17e-23■■■■□ 22.6
PCBP2Q15366 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-10■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.423e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.853e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 310.25□□□□□ -0.776e-26■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 226.09■■□□□ 1.775e-8■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 423.29■■□□□ 1.325e-8■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 314.45□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 36.82□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 AMDHD2-215ENST00000568263 1482 ntTSL 217.18■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.99e-8■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.769e-8■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-209ENST00000538034 453 ntTSL 515.02■□□□□ -01e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-206ENST00000535357 597 ntTSL 37.59□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.289e-14■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.339e-14■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 AAMP-206ENST00000461911 567 ntTSL 211.01□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 49.33□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22.5
PCBP2Q15366 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 22.5
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