Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPQQ9Y646 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPQQ9Y646 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms