Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SAMM50Q9Y512 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMM50Q9Y512 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms