Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P5

SLC27A5, Bile acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A5Q9Y2P5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A5Q9Y2P5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A5Q9Y2P5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A5Q9Y2P5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A5Q9Y2P5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A5Q9Y2P5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms