Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNPO2Q9UMS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNPO2Q9UMS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNPO2Q9UMS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNPO2Q9UMS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNPO2Q9UMS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms