Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SYNPO2Q9UMS6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNPO2Q9UMS6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYNPO2Q9UMS6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNPO2Q9UMS6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNPO2Q9UMS6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
SYNPO2Q9UMS6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SYNPO2Q9UMS6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNPO2Q9UMS6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SYNPO2Q9UMS6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SYNPO2Q9UMS6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYNPO2Q9UMS6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYNPO2Q9UMS6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SYNPO2Q9UMS6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SYNPO2Q9UMS6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SYNPO2Q9UMS6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYNPO2Q9UMS6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYNPO2Q9UMS6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNPO2Q9UMS6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNPO2Q9UMS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNPO2Q9UMS6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNPO2Q9UMS6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNPO2Q9UMS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNPO2Q9UMS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SYNPO2Q9UMS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYNPO2Q9UMS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNPO2Q9UMS6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYNPO2Q9UMS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNPO2Q9UMS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNPO2Q9UMS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNPO2Q9UMS6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYNPO2Q9UMS6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNPO2Q9UMS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNPO2Q9UMS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYNPO2Q9UMS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNPO2Q9UMS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNPO2Q9UMS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNPO2Q9UMS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNPO2Q9UMS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNPO2Q9UMS6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNPO2Q9UMS6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNPO2Q9UMS6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNPO2Q9UMS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNPO2Q9UMS6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNPO2Q9UMS6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNPO2Q9UMS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNPO2Q9UMS6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNPO2Q9UMS6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNPO2Q9UMS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SYNPO2Q9UMS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYNPO2Q9UMS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYNPO2Q9UMS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNPO2Q9UMS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SYNPO2Q9UMS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYNPO2Q9UMS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SYNPO2Q9UMS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNPO2Q9UMS6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNPO2Q9UMS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNPO2Q9UMS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNPO2Q9UMS6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNPO2Q9UMS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNPO2Q9UMS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNPO2Q9UMS6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYNPO2Q9UMS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYNPO2Q9UMS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYNPO2Q9UMS6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNPO2Q9UMS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNPO2Q9UMS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNPO2Q9UMS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNPO2Q9UMS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNPO2Q9UMS6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNPO2Q9UMS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNPO2Q9UMS6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNPO2Q9UMS6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNPO2Q9UMS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYNPO2Q9UMS6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYNPO2Q9UMS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNPO2Q9UMS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYNPO2Q9UMS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNPO2Q9UMS6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNPO2Q9UMS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNPO2Q9UMS6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNPO2Q9UMS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNPO2Q9UMS6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms