Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP2Q9UHC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNTNAP2Q9UHC6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTNAP2Q9UHC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms