Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXC10Q9NYD6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC10Q9NYD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXC10Q9NYD6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC10Q9NYD6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms