Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM60AQ9NP50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM60AQ9NP50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM60AQ9NP50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms