Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HEPHQ9BQS7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HEPHQ9BQS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HEPHQ9BQS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HEPHQ9BQS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms