Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UHRF1Q96T88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UHRF1Q96T88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UHRF1Q96T88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms