Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JSRP1Q96MG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JSRP1Q96MG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms