Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
TRIM52Q96A61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM52Q96A61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM52Q96A61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms