Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.17■■■■■ 5.78
TRIM52Q96A61 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
TRIM52Q96A61 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
TRIM52Q96A61 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
TRIM52Q96A61 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
TRIM52Q96A61 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
TRIM52Q96A61 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.42■■■■■ 5.5
TRIM52Q96A61 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
TRIM52Q96A61 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
TRIM52Q96A61 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
TRIM52Q96A61 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
TRIM52Q96A61 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
TRIM52Q96A61 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
TRIM52Q96A61 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
TRIM52Q96A61 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
TRIM52Q96A61 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
TRIM52Q96A61 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.39■■■■■ 5.18
TRIM52Q96A61 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
TRIM52Q96A61 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
TRIM52Q96A61 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
TRIM52Q96A61 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
TRIM52Q96A61 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TRIM52Q96A61 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
TRIM52Q96A61 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
TRIM52Q96A61 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TRIM52Q96A61 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TRIM52Q96A61 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
TRIM52Q96A61 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
TRIM52Q96A61 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TRIM52Q96A61 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TRIM52Q96A61 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
TRIM52Q96A61 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
TRIM52Q96A61 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
TRIM52Q96A61 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
TRIM52Q96A61 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
TRIM52Q96A61 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
TRIM52Q96A61 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
TRIM52Q96A61 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
TRIM52Q96A61 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TRIM52Q96A61 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
TRIM52Q96A61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
TRIM52Q96A61 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
TRIM52Q96A61 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
TRIM52Q96A61 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM52Q96A61 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM52Q96A61 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TRIM52Q96A61 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
TRIM52Q96A61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
TRIM52Q96A61 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TRIM52Q96A61 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
TRIM52Q96A61 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TRIM52Q96A61 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
TRIM52Q96A61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
TRIM52Q96A61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
TRIM52Q96A61 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TRIM52Q96A61 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
TRIM52Q96A61 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
TRIM52Q96A61 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TRIM52Q96A61 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
TRIM52Q96A61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TRIM52Q96A61 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TRIM52Q96A61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
TRIM52Q96A61 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TRIM52Q96A61 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
TRIM52Q96A61 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
TRIM52Q96A61 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TRIM52Q96A61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
TRIM52Q96A61 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TRIM52Q96A61 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TRIM52Q96A61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
TRIM52Q96A61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TRIM52Q96A61 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TRIM52Q96A61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
TRIM52Q96A61 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRIM52Q96A61 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TRIM52Q96A61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
TRIM52Q96A61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TRIM52Q96A61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRIM52Q96A61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRIM52Q96A61 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TRIM52Q96A61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TRIM52Q96A61 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
TRIM52Q96A61 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TRIM52Q96A61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM52Q96A61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM52Q96A61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM52Q96A61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRIM52Q96A61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM52Q96A61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM52Q96A61 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TRIM52Q96A61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRIM52Q96A61 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
TRIM52Q96A61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TRIM52Q96A61 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TRIM52Q96A61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms