Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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