Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APCDD1LQ8NCL9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APCDD1LQ8NCL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms