Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
APCDD1LQ8NCL9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
APCDD1LQ8NCL9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
APCDD1LQ8NCL9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
APCDD1LQ8NCL9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
APCDD1LQ8NCL9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
APCDD1LQ8NCL9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APCDD1LQ8NCL9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APCDD1LQ8NCL9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APCDD1LQ8NCL9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APCDD1LQ8NCL9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
APCDD1LQ8NCL9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
APCDD1LQ8NCL9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APCDD1LQ8NCL9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APCDD1LQ8NCL9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APCDD1LQ8NCL9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APCDD1LQ8NCL9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
APCDD1LQ8NCL9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APCDD1LQ8NCL9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
APCDD1LQ8NCL9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APCDD1LQ8NCL9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APCDD1LQ8NCL9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APCDD1LQ8NCL9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APCDD1LQ8NCL9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APCDD1LQ8NCL9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APCDD1LQ8NCL9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APCDD1LQ8NCL9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APCDD1LQ8NCL9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APCDD1LQ8NCL9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APCDD1LQ8NCL9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APCDD1LQ8NCL9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APCDD1LQ8NCL9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APCDD1LQ8NCL9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APCDD1LQ8NCL9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APCDD1LQ8NCL9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APCDD1LQ8NCL9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APCDD1LQ8NCL9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APCDD1LQ8NCL9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APCDD1LQ8NCL9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APCDD1LQ8NCL9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APCDD1LQ8NCL9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APCDD1LQ8NCL9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
APCDD1LQ8NCL9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APCDD1LQ8NCL9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APCDD1LQ8NCL9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APCDD1LQ8NCL9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APCDD1LQ8NCL9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
APCDD1LQ8NCL9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APCDD1LQ8NCL9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APCDD1LQ8NCL9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APCDD1LQ8NCL9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APCDD1LQ8NCL9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APCDD1LQ8NCL9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APCDD1LQ8NCL9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APCDD1LQ8NCL9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APCDD1LQ8NCL9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APCDD1LQ8NCL9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APCDD1LQ8NCL9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APCDD1LQ8NCL9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APCDD1LQ8NCL9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APCDD1LQ8NCL9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APCDD1LQ8NCL9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APCDD1LQ8NCL9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APCDD1LQ8NCL9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APCDD1LQ8NCL9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APCDD1LQ8NCL9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APCDD1LQ8NCL9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APCDD1LQ8NCL9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APCDD1LQ8NCL9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APCDD1LQ8NCL9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APCDD1LQ8NCL9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APCDD1LQ8NCL9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APCDD1LQ8NCL9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APCDD1LQ8NCL9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APCDD1LQ8NCL9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APCDD1LQ8NCL9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APCDD1LQ8NCL9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms